Chương trình hợp tác được xúc tiến nhằm tập hợp và phát huy trí tuệ của đội ngũ cán bộ khoa học - công nghệ (KH-CN) ở mọi thành phần kinh tế; tăng cường hiệu quả hoạt động của Liên hiệp hội; nâng cao vai trò và năng lực của các tổ chức KH-CN ngoài Nhà nước trên cơ sở phát huy chức năng tập hợp trí tuệ của Liên hiệp hội phục vụ sự nghiệp phát triển nông nghiệp và xây dựng NTM tại địa phương.

Cụ thể, 2 bên sẽ phối hợp với nhau trong nghiên cứu, hoàn thiện cơ chế, chính sách, pháp luật về phát triển nông nghiệp bền vững và xây dựng NTM gắn với chương trình KH-CN trong nông nghiệp. Nghiên cứu, đánh giá tác động của các chính sách, chương trình, dự án phát triển nông nghiệp, nông thôn; tư vấn, xây dựng chính sách phát triển nông nghiệp - NTM.

Tuyên truyền nâng cao nhận thức và tăng cường năng lực cho nông dân thực hiện Chương trình  mục tiêu Quốc gia xây dựng NTM; vận động các nhà khoa học và các tổ chức chính trị - xã hội, tổ chức chính trị - xã hội - nghề nghiệp tham gia xây dựng NTM.

Tăng cường hoạt động khuyến nông - lâm - ngư và ứng dụng tiến bộ KH-CN vào sản xuất nông, lâm, ngư nghiệp; đào tạo hướng dẫn và chuyển giao tiến bộ KH-CN tiên tiến cho nông dân về quản lý, sản xuất hàng hóa nông nghiệp theo hướng an toàn, xanh, sạch và phát triển bền vững.

Xây dựng mô hình NTM, mô hình liên kết trong sản xuất, chế biến và tiêu thụ sản phẩm nông nghiệp, mô hình giảm nghèo bền vững. Bảo vệ môi trường nông nghiệp, nông thôn; bảo tồn và phát triển các làng nghề truyền thống “xanh, sạch, đẹp”.